<object id="yqkiu"><wbr id="yqkiu"></wbr></object><acronym id="yqkiu"><wbr id="yqkiu"></wbr></acronym>
<object id="yqkiu"><wbr id="yqkiu"></wbr></object>
<sup id="yqkiu"><wbr id="yqkiu"></wbr></sup>
24小時(shí)*365天服務(wù)熱線(xiàn): 400-888-1223 | 員工通道
微信二維碼
在線(xiàn)客服
返回頂部
Label-free 非標定量蛋白組

在蛋白質(zhì)組學(xué)研究領(lǐng)域,基于液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS/MS)技術(shù)可在生物樣本中檢測和相對定量上千個(gè)蛋白,目前已被廣泛應用。Label-free技術(shù)具有不受樣品標記數量限制,蛋白定量動(dòng)態(tài)范圍廣,樣品起始量低等優(yōu)點(diǎn);是目前蛋白組研究領(lǐng)域廣受歡迎的研究方法。

Label-freeDDA,Data Dependent Acquisition)技術(shù)對每個(gè)樣品分別進(jìn)行蛋白提取、蛋白酶解、肽段分離和質(zhì)譜檢測,利用二級圖譜進(jìn)行蛋白鑒定,利用肽段峰面積信息進(jìn)行蛋白定量。

華銀康高通量測序中心能提供Label-free DDA Label-free DIA兩種檢測技術(shù),助力科研人員對蛋白組定量的研究。


技術(shù)參數

樣品量

細胞類(lèi)(>2×106細胞,離心沉淀>20ul
動(dòng)物組織(>50mg
植物組織(>500mg
體液(血液>200ul,尿液>20ml
其他(樣品內蛋白/肽段>50ug

樣品要求

樣品無(wú)污染
樣品采集后速凍(-80/液氮)
樣品標識清楚
干冰寄送(10kg干冰)

重復

建議至少設置3個(gè)生物重復

數據量

1組分*1小時(shí)梯度(簡(jiǎn)單樣品)
1組分*2小時(shí)梯度(復雜樣品)

質(zhì)譜儀

QExactive
QExactiveHF


技術(shù)優(yōu)勢

(1)更符合樣本真實(shí)蛋白表達結果:更全面和權威的數據庫和軟件,同一樣本能鑒定到更多的蛋白質(zhì)種類(lèi);

(2)更專(zhuān)業(yè)的生信團隊,具有多年的蛋白組學(xué)分析經(jīng)驗,能提供各種個(gè)性化的高級分析。


信息分析

生信分析總流程

 

標準信息分析
1)蛋白鑒定
2)蛋白功能注釋?zhuān)篏O、KEGG、COG、EggNOG注釋、亞細胞定位分析、轉錄因子分析、蛋白激酶分析
3)蛋白定量:樣品間蛋白強度分布 、聚類(lèi)、PCA分析、相關(guān)性和重復性分析
4)差異蛋白篩選
5) 差異蛋白功能注釋?zhuān)篏O、KEGG、COG、EggNOG注釋、亞細胞定位分析、轉錄因子分析、蛋白激酶分析
6)多比較組分析
7)其他高級分析

高級分析示例圖

 

案例分析

蛋白質(zhì)組學(xué)衍生的生物標志物組合提高了子宮內膜樣和高度漿液性卵巢癌分類(lèi)的診斷精度

卵巢癌是一種難治性疾病,在美國女性中的發(fā)病率為1.27%,其5年存活率只有46%。上皮性卵巢癌是一種生物學(xué)上異質(zhì)性疾病,根據其組織特異性細分為5種亞型,它們按照發(fā)病率遞減排序是:高度漿液(HGSC)、子宮內膜狀、透明細胞型(CCC)、低度漿液性和粘液性卵巢癌。這些亞型代表了潛在的分子改變和臨床癥狀的差異,隨著(zhù)組織特異性治療理念的發(fā)展,準確的分類(lèi)將成為精確醫學(xué)治療的前提。為了揭示兩種最常見(jiàn)的卵巢癌臨床亞型——HGSC和子宮內膜癌之間的差異,研究者通過(guò)lable-free方法比較了HGSC(10例)和子宮內膜癌(10例)的蛋白組成。結果鑒定出8種在子宮內膜癌中特異的蛋白標志物,然后使用免疫組化(IHC),在361例樣本中驗證了這8個(gè)蛋白的分類(lèi)效果。

子宮內膜癌和HGSC的蛋白質(zhì)組之間差異表達的蛋白質(zhì)有500多種(P<0.05),排名靠前的106種蛋白足以正確區分90%的樣品。IHC驗證出KIAA1324是一種新的子宮內膜癌最有特異性的生物標志物。與僅使用WT1加TP53的診斷標準相比,本研究發(fā)現的8個(gè)蛋白標記物區分子宮內膜癌和HGSC的準確性更高,可以將HGSC的診斷率從90.7%提高到99.2%。子宮內膜癌特異性診斷標志物,如PLCB1,KIAA1324和SCGB2A1也與子宮內膜癌的良好預后顯著(zhù)相關(guān),表明該臨床亞型具有生物學(xué)異質(zhì)性。蛋白質(zhì)組學(xué)數據的通路分析顯示子宮內膜癌和HGSC在雌激素和干擾素信號傳導方面的差異。

 

1 子宮內膜癌和HGSC的蛋白組數據比較

 

2 選擇子宮內膜癌蛋白標志物做下游驗證


Dieters-Castator, D. Z., et al. (2019). "Proteomics-Derived Biomarker Panel Improves Diagnostic Precision to Classify Endometrioid and High-grade Serous Ovarian Carcinoma." Clin Cancer Res 25(14): 4309-4319.

忘忧草视频在线观看,体育生小鲜肉勃起VIDEOS,亚洲熟伦熟女专区HD高清,狮王的巨大挺进体内H
丽水市| 乌兰浩特市| 芒康县| 增城市| 嘉善县| 施甸县| 河北区| 松阳县| 佛山市| 龙里县| 贺兰县| 保定市| 盘锦市| 固原市| 山阳县| 资阳市| 射阳县| 南开区| 防城港市| 广昌县| 宝鸡市| 桐乡市| 云南省| 郎溪县| 兴义市| 彰武县| 乡城县| 长阳| 诸暨市| 庆云县| 邢台市| 林周县| 汉沽区| 成安县| 乐东| 玛多县| 宝山区| 霍州市| 南靖县| 绩溪县| 四平市| http://www.qqsql.com http://www.dlbxgg.com http://www.51hct.com http://www.8808mu.com http://www.ikbao.com http://www.c4c2.com