ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with High-Throughput Sequencing）是利用高活性轉座酶Tn5探究染色質(zhì)可接近性的高通量測序技術(shù)。具體來(lái)說(shuō)就是利用轉座酶Tn5來(lái)捕獲全基因組范圍內開(kāi)放性染色質(zhì)，再通過(guò)高通量測序及生物信息學(xué)分析來(lái)挖掘相關(guān)基因和順式調控元件信息，以此探究轉錄調控相關(guān)問(wèn)題。
※ATAC-seq與RNA-seq、CUT&Tag等多組學(xué)和多技術(shù)聯(lián)合分析，獲取基因表達與上游調控元件、轉錄因子的關(guān)聯(lián)信息，解析轉錄因子靶向調控變化機制。
一站式服務(wù)：提供樣品處理、ATAC建庫、測序和分析的全套服務(wù)。
新鮮或凍存動(dòng)物組織樣本：≥100mg。
技術(shù)流程
實(shí)測數據
經(jīng)典案例
自然殺傷細胞中全局細胞因子信號網(wǎng)絡(luò )的解構：
利用信號轉導因子和轉錄激活蛋白（STAT）的細胞因子信號轉導對于自然殺傷（NK）細胞的最佳抗病毒反應至關(guān)重要。采用了ATAC-seq、RNA-seq和ChIP-seq多組學(xué)方法解構和重建NK細胞中多種細胞因子信號通路的復雜互作，發(fā)現促炎細胞因子和穩態(tài)細胞因子形成協(xié)同軸，共同調節整體基因表達并進(jìn)一步抑制由 I 型干擾素信號傳導誘導的表達，這些細胞因子通過(guò)STAT蛋白和集體信號介導不同的表觀(guān)遺傳調控模式，最佳地概括了全局抗病毒反應。
參考文獻：Wiedemann G M, Santosa E K, Grassmann S, et al. Deconvoluting global cytokine signaling networks in natural killer cells[J]. Nature immunology, 2021, 22(5): 627-638.
