甲基化特異性PCR(MSP)
【技術(shù)簡(jiǎn)介】
(1)技術(shù)原理
甲基化特異性的PCR是一種靈敏度高且操作相對簡(jiǎn)單的甲基化研究方法。重亞硫酸鹽處理DNA后,基因組DNA發(fā)生的由甲基化狀態(tài)決定的序列改變。隨后進(jìn)行引物特異性的PCR。該方法引物設計是關(guān)鍵。MSP中設計兩對引物,即一對結合處理后的甲基化DNA鏈(引物對M),另一對結合處理后的非甲基化DNA鏈(引物對U)。檢測MSP擴增產(chǎn)物,如果用引物M能擴增出片段,則說(shuō)明檢測位點(diǎn)存在甲基化;若用引物U擴增出片段,則說(shuō)明被檢測的位點(diǎn)不存在甲基化。
(2)技術(shù)應用
腫瘤的早期預測、分類(lèi)分級、預后評估及多種疾病的分析;轉錄水平分析:位于啟動(dòng)子區域的甲基化一般會(huì )抑制轉錄;細胞凋亡等調控機制的研究。
【服務(wù)內容】
根據待測基因序列設計相應引物;基因組DNA的提取和質(zhì)量檢測;亞硫酸氫鈉修飾基因組DNA;修飾后DNA純化回收;根據實(shí)驗的要求進(jìn)行BSP或者qMSP實(shí)驗;實(shí)驗結果的分析以及向客戶(hù)提供實(shí)驗報告。
【客戶(hù)須知及標本要求】
(1)組織樣品:新鮮組織放入液氮或-80度保存,組織不少于100mg;
(2)培養細胞:通過(guò)細胞計數取不少于2×106個(gè)細胞于EP管,加入0.5ml生理鹽水或蛋白保護劑,混勻后保存于冰箱(-80℃,避免反復凍融);
(3)血液細胞標本:以抗凝管保存血樣或以淋巴細胞分離液分離細胞后加入0.5ml生理鹽水或蛋白保護劑,保存(-80℃可長(cháng)期保存,避免反復凍融);
(4)血清或細胞培養液標本:離心去掉雜質(zhì)后取上清入EP管,保存(4℃可保存15-20天,-80℃可長(cháng)期保存,避免反復凍融);
(5)樣本運輸:可選擇以下任何一種方式寄送標本
組織樣本、細胞樣本以干冰運輸或加入蛋白保護劑后,加冰袋寄送;
細胞樣本也可直接寄送培養瓶(密封保證不污染、培養液不漏出);
血清或上清液直接加冰袋寄送(運送視路程遠近2-3天可到達)。