喜報(bào) | 發(fā)明專利再獲授權(quán),華銀康免疫組庫又有新高度!
2022-11-21
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近日,廣州華銀康醫(yī)療集團(tuán)股份有限公司“篩選免疫組庫測序生物標(biāo)志物的方法、設(shè)備和存儲介質(zhì)”獲專利授權(quán),標(biāo)志著華銀康在免疫組庫高通量測序分析研發(fā)上又有重大突破,免疫組庫生物標(biāo)志物的篩選將更具可靠性。
免疫組庫高通量測序是通過多重PCR或SMART RACE法擴(kuò)增TCR/BCR全長或CDR3區(qū)序列(主要是TCR的β鏈或BCR的重鏈),再結(jié)合高通量測序技術(shù),對機(jī)體免疫組庫的多樣性及每種T、B細(xì)胞克隆的獨(dú)特性序列組成和變化進(jìn)行分析,從而全面評估機(jī)體的免疫狀態(tài),明確疾病與T、B細(xì)胞克隆組成及變化之間的關(guān)系。隨著免疫組庫測序技術(shù)的不斷發(fā)展,其在多樣性生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)、腫瘤等疾病療效預(yù)測、疾病的易感性和抵抗性、感染性、疾病及疫苗研究等方面都具有重要價(jià)值。
傳統(tǒng)用于篩選免疫組庫測序生物標(biāo)志物的方法是,主要依賴于宏觀層面的克隆多樣性來對疾病的檢測、進(jìn)展和預(yù)后進(jìn)行判別,但在發(fā)現(xiàn)那些執(zhí)行主要免疫功能的優(yōu)勢克隆方面存在欠缺;另外,傳統(tǒng)的用于篩選免疫組庫測序生物標(biāo)志物的方法是采用t檢驗(yàn),未考慮克隆基因的種類對顯著性差異的影響;因此,容易導(dǎo)致篩選結(jié)果的可靠性不夠高。
廣州華銀康醫(yī)療集團(tuán)股份有限公司《篩選免疫組庫測序生物標(biāo)志物的方法、設(shè)備和存儲介質(zhì)》涉及的方法包括:確定樣本中的每一種克隆的初始絕對豐度;基于樣品內(nèi)克隆基因的初始絕對豐度、樣品有克隆的絕對豐度的總和,計(jì)算樣品內(nèi)克隆基因的第一相對豐度;響應(yīng)于確定克隆基因的初始絕對豐度大于預(yù)定閾值,確定克隆基因的第一絕對豐度為1;基于樣品內(nèi)克隆基因的第一絕對豐度、樣品內(nèi)所有克隆的第一絕對豐度的總和,計(jì)算樣品內(nèi)克隆基因的第二相對豐度;針對候選克隆基因進(jìn)行第一檢驗(yàn)和第二檢驗(yàn),以便確定免疫組庫測序生物標(biāo)志物,第二檢驗(yàn)不同于第一檢驗(yàn)。本專利能夠顯著提高所篩選出的免疫組庫的生物標(biāo)志物的可靠性。
系統(tǒng)示意圖和方法流程圖
上圖是本專利篩選免疫組庫生物標(biāo)志物的系統(tǒng)示意圖和方法流程圖,第二相對豐度在克隆基因的定量上不考慮克隆的絕對豐度,能夠從克隆的種類方面考察克隆在樣本中的重要性。
上圖是用于生成校驗(yàn)結(jié)果數(shù)據(jù)的方法流程圖和篩選免疫組庫生物標(biāo)志物的方法流程圖,本專利能通過兩種定量方法同時(shí)從克隆的整體表達(dá)量和克隆種類兩方面考察克隆的重要性。
本專利還提供了一種計(jì)算設(shè)備和一種計(jì)算機(jī)可讀存儲介質(zhì),便于執(zhí)行篩選免疫組庫測序生物標(biāo)志物的過程。