喜報 | 發(fā)明專(zhuān)利再獲授權,華銀康免疫組庫又有新高度!
2022-11-21
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近日,廣州華銀康醫療集團股份有限公司“篩選免疫組庫測序生物標志物的方法、設備和存儲介質(zhì)”獲專(zhuān)利授權,標志著(zhù)華銀康在免疫組庫高通量測序分析研發(fā)上又有重大突破,免疫組庫生物標志物的篩選將更具可靠性。
免疫組庫高通量測序是通過(guò)多重PCR或SMART RACE法擴增TCR/BCR全長(cháng)或CDR3區序列(主要是TCR的β鏈或BCR的重鏈),再結合高通量測序技術(shù),對機體免疫組庫的多樣性及每種T、B細胞克隆的獨特性序列組成和變化進(jìn)行分析,從而全面評估機體的免疫狀態(tài),明確疾病與T、B細胞克隆組成及變化之間的關(guān)系。隨著(zhù)免疫組庫測序技術(shù)的不斷發(fā)展,其在多樣性生物標志物的發(fā)現、腫瘤等疾病療效預測、疾病的易感性和抵抗性、感染性、疾病及疫苗研究等方面都具有重要價(jià)值。
傳統用于篩選免疫組庫測序生物標志物的方法是,主要依賴(lài)于宏觀(guān)層面的克隆多樣性來(lái)對疾病的檢測、進(jìn)展和預后進(jìn)行判別,但在發(fā)現那些執行主要免疫功能的優(yōu)勢克隆方面存在欠缺;另外,傳統的用于篩選免疫組庫測序生物標志物的方法是采用t檢驗,未考慮克隆基因的種類(lèi)對顯著(zhù)性差異的影響;因此,容易導致篩選結果的可靠性不夠高。
廣州華銀康醫療集團股份有限公司《篩選免疫組庫測序生物標志物的方法、設備和存儲介質(zhì)》涉及的方法包括:確定樣本中的每一種克隆的初始絕對豐度;基于樣品內克隆基因的初始絕對豐度、樣品有克隆的絕對豐度的總和,計算樣品內克隆基因的第一相對豐度;響應于確定克隆基因的初始絕對豐度大于預定閾值,確定克隆基因的第一絕對豐度為1;基于樣品內克隆基因的第一絕對豐度、樣品內所有克隆的第一絕對豐度的總和,計算樣品內克隆基因的第二相對豐度;針對候選克隆基因進(jìn)行第一檢驗和第二檢驗,以便確定免疫組庫測序生物標志物,第二檢驗不同于第一檢驗。本專(zhuān)利能夠顯著(zhù)提高所篩選出的免疫組庫的生物標志物的可靠性。
系統示意圖和方法流程圖
上圖是本專(zhuān)利篩選免疫組庫生物標志物的系統示意圖和方法流程圖,第二相對豐度在克隆基因的定量上不考慮克隆的絕對豐度,能夠從克隆的種類(lèi)方面考察克隆在樣本中的重要性。
上圖是用于生成校驗結果數據的方法流程圖和篩選免疫組庫生物標志物的方法流程圖,本專(zhuān)利能通過(guò)兩種定量方法同時(shí)從克隆的整體表達量和克隆種類(lèi)兩方面考察克隆的重要性。
本專(zhuān)利還提供了一種計算設備和一種計算機可讀存儲介質(zhì),便于執行篩選免疫組庫測序生物標志物的過(guò)程。