關(guān)于白血病中51融合基因篩查檢測項目開(kāi)展通知
2018-05-31 閱讀數:9068
尊敬的客戶(hù):
您好!非常感謝您對廣州華銀醫學(xué)檢驗中心的支持和幫助!
由于白血病中51融合基因篩查開(kāi)展,故自2018年06月01日起送檢的上述標本的新項目開(kāi)展,具體說(shuō)明如下:
一、項目名稱(chēng)
白血病中51融合基因篩查
二、臨床意義
用于篩查白血病患者48(+3)種融合基因類(lèi)型
三、臨床背景
大部分白血病存在某種染色體改變,產(chǎn)生新的編碼融合蛋白的融合基因,迄今報道白血病涉及至少50多種典型的類(lèi)型特異的染色體易位,涉及大量基因融合。如在>95%的CML患者中存在BCR-ABL(t(9;22)(q34;q11))融合基因;95%的APL患者攜帶PML-RARα(t(15;17)(q22;q12))融合基因,這類(lèi)融合基因通常被認為是與其相關(guān)的白血病的重要診斷標志,可通過(guò)檢測該類(lèi)融合基因來(lái)輔助診斷白血病,確定具有不同發(fā)病機制的白血病群,探索發(fā)病原因。世界衛生組織(WHO)2008再版白血病分類(lèi)方案中,要求對患者在形態(tài)學(xué)、免疫表型、遺傳特性和分子特征綜合考慮,其中融合易位是最重要的遺傳/分子診斷依據之一。在預后評估中,不同的融合基因反映同中疾病中不同預后分層,如據中華醫學(xué)會(huì )兒童急淋指南,兒童ALL高發(fā)重排包括ETV6-RUNX1、E2A-PBX1、MLL重排、BCR-ABL1,前兩種重排總體臨床危險度為低?;蛑形?,后兩者往往歸為高危;在微小殘留監測中,篩選出的陽(yáng)性標記物隨治療進(jìn)展進(jìn)行監測,如據歐洲白血病指南,CBFB-MYH11、 RUNX1-RUNX1T1、BCR-ABL1等融合基因的RQ-PCR檢測可用于AML療效監測。
以下為廠(chǎng)商提供的48種融合基因的意義(另外3中是融合基因下的細分亞型):
序號 |
融合基因 |
染色體易位 |
融合基因說(shuō)明 |
1 |
MLL-AF9 |
t(9;11)(p22;q23) |
主要發(fā)生在 AML 中。該融合基因往往提示較差的預后。 |
2# |
PML-RARα |
t(15;17)(q24;q21) |
在 APL 中的發(fā)生率為 95%。該融合基因可作為診斷和輔助分型 M3 的特異標記,該融合基因提示患者對全反式維甲酸和三氧化二砷治療有效,且有比較好的預后。 |
3 |
AML1-ETO |
t(8;21)( q22; q22) |
約 20-40%的 AML-M2 患者有 AML1-ETO,其中 90%的 M2b 亞型含有 AML1-ETO 融合基因并且年齡越小發(fā)生率越高。含有 AML1-ETO 的 AML 患者對大劑量阿糖胞苷治療效果好,具有較高的緩解率,無(wú)病生存期長(cháng),預后較其他 AML 亞型(M3 除外)好。 |
4 |
MLL-AF4 |
t(4;11)(q21;q23) |
嬰兒 ALL 中發(fā)生率為 50-70%,兒童發(fā)生率為 2%,成人中發(fā)生率為 3-6%。含有 MLL-AF4 的患者發(fā)病年齡較低(通常小于 2 歲),病情兇險,預后差?;颊邔藴手委煼桨缚赡軣o(wú)效,需要強化治療。目前應用高劑量 Ara-c 治療,可提高患者預后。 |
5 |
TEL-AML1 |
t(12;21)(p13;q22) |
在兒童 ALL 中發(fā)生率為 25%,目前尚未在 T-ALL,AML 或 NHL 中發(fā)現,在成人白血病患者中發(fā)生頻率一般低于 2%,一般發(fā)病年齡小(2-10 歲),WBC 計數低(<50000/L)。此類(lèi)患者的免疫表型為前 B-ALL,對治療反應佳,完全緩解時(shí)間長(cháng),預后好,可用于區分低危險度和高危險度的 ALL 患者,有助于確定合適的治療方案。 |
6 |
E2A-PBX1 |
t(1;19)(q23;p13) |
存在于約 3-5%的兒童 ALL 和 3%的成人 ALL。是預后不良的因素,但文獻報道不是所有的 E2A-PBX1陽(yáng)性患者都對治療反應不良。E2A-PBX1 表達陽(yáng)性的兒童 ALL 病例初診時(shí)白細胞計數較高,使用強化療方案后,EFSs 現已接近 80%。 |
7 |
FIP1L1-PDGFRA |
del(4)(q12) |
見(jiàn)于約 10-15%的特發(fā)性嗜酸粒細胞增多患者(HES、CEL 等)。該融合基因提示對格列衛有較好的反應。 |
8 |
MLL-ENL |
t(11;19)(q23;p13.3) |
可見(jiàn)于 ALL,AML-M4,M5,M1,M2,患者多為小于 1 歲的嬰兒。該融合基因預后尚無(wú)明確說(shuō)明,與年齡,免疫表型相關(guān)。 |
9# |
BCR-ABL1 |
t(9;22)(q34;q11) |
存在于大約 95%的 CML 病人和 20%的 ALL 病人。BCR/ABL b2a2 和 b3a2 型已經(jīng)成為 CML 的主要診斷標準,并可指導格列衛的使用,評估預后效果和病情復發(fā)情況。e1a2 型融合基因主要見(jiàn)于約 3~5% 的兒童 ALL 和 1/3 的成人 ALL,是 ALL 患者預后較差的因素,該類(lèi)患者 5 年存活率<20%,因此這類(lèi)患者需要在緩解后進(jìn)行骨髓移植治療。 |
10 |
SIL-TAL1 |
del(1)(p32) |
發(fā)生在 26%的兒童 T-ALL 和 16%的成人。該融合基因可用于輔助 T-ALL 的診斷,療效監測和 MRD。 |
11 |
MLL-AF10 |
t(10;11)(p12;q23) |
是 AML-M5 型的特異性標志,多見(jiàn)于兒童,80%的患者小于 3 歲。該融合基因往往提示較差的預后。 |
12 |
CBFβ-MYH11 |
inv(16)(p13;q22) |
主要見(jiàn)于 30-100% 的 M4Eo 和 10%的不伴異常嗜酸細胞 M4,少見(jiàn)于 M2,是預后較好的因素。該融合基因可作為診斷及分型 M4Eo 的特異標記,其融合基因轉錄水平可以用來(lái)評價(jià) M4Eo 患者 MRD 情況,預見(jiàn)復發(fā)。 |
13 |
AML1-MDS1/EV11 |
t(3;21)(q26; q22) |
MDS1和EVI1基因均位于3q26且位置相鄰,可形成 MDS1-EVI1復合體(MECOM基因),進(jìn)而形成RUNX1-MDS1-EVI1融合基因。AML1/MDS1 融合基因首先發(fā)現于CML-BC的患者,在CML-CP、少數治療相關(guān)AML、原發(fā)AML或MDS以及MDS后AML中也可見(jiàn)到。該融合基因提示預后不良,生存率低。 |
14 |
MLL-AFX1 |
t(x;11)( q13; q23) |
研究發(fā)現可以增強造血干細胞的自我更新并組織它們成熟。預后差。 |
15 |
SET-CAN |
del(9)(q34) |
存在于AUL(Acute UndifferentiatedLeukemia),AML和ALL中。目前預后意義不明確。 |
16 |
E2A-HLF |
t(17;19)(q22;p13) |
發(fā)生在少數的ALL中。該融合基因提示預后差,對密集化療無(wú)反應,生存期短。 |
17 |
DEK-CAN |
t(6;9)(p23;q34) |
在AML中占2%,主要為M2 型,其次為 M4 型,多發(fā)于年輕患者(20-30 歲),預后不良。該融合基因可以用于AML的診斷,療效觀(guān)察及預后判斷。 |
18 |
MLL-SEPT6 |
t(X;11)(q24;q23) |
發(fā)現于嬰兒AML中。目前,預后意義尚不明確。 |
19 |
TLS-ERG |
t(16;21)(p11;q22) |
存在于AML、ALL、CML急變病人中,在非白血?。ㄓ纫蚴先饬觯┲幸泊嬖?。該融合基因陽(yáng)性的急性白血病患者常病情嚴重,是提示預后不好的因素。 |
20 |
TEL-PDGFRB |
t(5;12)(q33;p13) |
多見(jiàn)于CML及MDS患者。此融合基因陽(yáng)性的患者常對格列衛治療有效。 |
21 |
MLL-ELL |
t(11;19)(q23;p13.1) |
為AML特異性異常,多發(fā)于成人。該融合基因提示預后不良,兩年無(wú)病生存率為50%。 |
22 |
MLL-AF17 |
t(11;17)(q23; q21) |
發(fā)現于AML中。預后意義尚不明確。 |
23 |
NPM-RARA |
t(5;17)(q35;q21) |
多發(fā)生于APL,含有該融合基因的患者往往維甲酸治療無(wú)效,而采用傳統的急性髓性白血病化療方案治療可能會(huì )有效。 |
24 |
NPM-MLF1 |
t(3;5)(q25;q34) |
多發(fā)生于AML,含有該融合基因的患者往往預后較差,雖然其有較高的治療緩解率,但是容易發(fā)生早期復發(fā),并且中位生存時(shí)間往往小于1年,這類(lèi)患者采用骨髓移植治療會(huì )好于化療。 |
25 |
PLZF-RARA |
t(11;17)(q23;q21) |
多發(fā)生在APL,含有該融合基因的患者往往維甲酸治療無(wú)效,而采用傳統的急性髓性白血病化療方案治療可能會(huì )有效。 |
26 |
MLL-AF1q |
t(1;11)(q21;q23) |
見(jiàn)于ANLL和ALL。AML 中高表達者治療效果較差,誘導緩解后復發(fā)率和死亡率高。 |
27 |
MLL-AF1P |
t(1;11)(p32;q23) |
在ALL,AML 和 MDS 中均有發(fā)生。預后與性別和分型相關(guān)。 |
28 |
TEL-ABL1 |
t(9;12) (q34;p13) |
可見(jiàn)于急性或慢性白血病、髓性細胞系或淋巴細胞系白血病。大部分病例伴隨嗜酸細胞增多,預后較差。 |
29 |
AML1-MTG16 |
t(16;21)(q24;q22) |
非常罕見(jiàn),主要發(fā)生在治療相關(guān)的AML或MDS中。攜帶該融合基因的患者對化療敏感,治療反應性好,但是化療毒性反應較強,需要采用較為緩和的化療方案。 |
30 |
AML1-EAP |
t(3;21)( q26; q22) |
主要發(fā)生在CML,MDS以及治療相關(guān)白血病,在AML中極少發(fā)生??勺鳛?/span>MDS向AML轉化過(guò)程的標志物。 |
31 |
MLL-AF6 |
t(6;11)(q27;q23) |
主要發(fā)生在 AML 中。該融合基因預后非常差,幾乎無(wú)緩解,生存期短。 |
32 |
NUP98-HOXA9 |
t(7;11)( p15; p15) |
多表現為 AML,也可見(jiàn)不伴有 t(9;22)的類(lèi) CML 表現或伴 t(9;22)原始細胞危象的 CML |
33 |
NUP98-HOXA11 |
t(7;11)( p15; p15) |
見(jiàn)于費城染色體陰性的 CML 和少年髓單核細胞性白血病。 |
34 |
NUP98-HOXA13 |
t(7;11)( p15; p15) |
見(jiàn)于初發(fā) AML。 |
35 |
NUP98-HOXC11 |
t(11;12)(p15;q13) |
僅在初發(fā) AML 中有病例報道。 |
36 |
NUP98-HOXD13 |
t(2;11)(q31;p15) |
目前僅在初發(fā) AML 中有病例報道。 |
37 |
NUP98-PMX1 |
t(1;11)(q23;p15) |
多見(jiàn)于 M2 型 ANLL 中。 |
38 |
ETV6-PDGFRA |
t(4;12)(q12;p13) |
提示對格列衛治療反應良好。 |
39 |
FIPIL1- RARα |
t(4;17)(q12;q21) |
發(fā)生于幼年型粒-單核細胞白血病。 |
40 |
STAT5B- RARα |
der(17)(q21) |
發(fā)生于 APL。 |
41 |
NUMA- RARα |
t(11;17)(q13;q21) |
發(fā)生于非典型的 M3 型 ANLL。 |
42 |
PRKAR1A- RARα |
der(17)(q21;q24) |
發(fā)生于 APL。 |
43 |
TEL-JAK2 |
t(9;12)( p24; p13) |
在 MDS 中發(fā)生率 36%,高危型 MDS 中發(fā)生率 63%,低危型 MDS 中發(fā)生率 25%,該基因有助于了解病情的嚴重程度。 |
44* |
CALM-AF10 |
t(10;11)(p13;q21) |
發(fā)病年齡低,預后不良。 |
45* |
EVI1 |
- |
陽(yáng)性 AML 患者和兒童ALL患者提示預后較差。同時(shí)是CML患者發(fā)生急性變的標志物。 |
46* |
HOX11 |
- |
HOX11 定位在 10q24 上,容易被 t(10;14)(q24;q11)或者 t(7;10)(q35;q24)易位激活,發(fā)生于 4-7%的 T-ALL 中。HOX11 高表達的兒童 T-ALL 預后比陰性有優(yōu)勢。 |
47* |
HOX11L2 |
- |
影響 AML 患者的預后。 |
48* |
dup MLL |
(11q23) |
預后差。臨床緩解率低。 |
備注:
#標注為亞型細分項目 BCR-ABL1細分210、190、230 共3種,PML-RARA 細分L、S、V共3種
*標注為原43或30不覆蓋的新基因
三、技術(shù)說(shuō)明
本檢測從血液中提取RNA并逆轉錄,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測目標融合基因。
1. 本方法是針對融合基因常見(jiàn)的已知的融合形式進(jìn)行設計,不排除罕見(jiàn)的融合位點(diǎn)存在,不排除假陰性的可能;
2. 本方法的靈敏度為融合基因100 copy、dup MLL和HOX11 1000 copy,該靈敏度適用于初診患者骨髓或外周血標本送檢。
五、臨床用途
本項目在30和43個(gè)融合基因的基礎上,有以下2個(gè)方面變化:
1.增加EVI1、HOX11、HOX11L2、dup MLL 和CALM-AF10 5個(gè)基因檢測,5個(gè)基因在AML和ALL中有一定的預后意義;
2.將常見(jiàn)的BCR-ABL和PML-RARA進(jìn)行亞型分型,以完善篩查項目在初診階段與后期監測階段項目的對接;
建議不滿(mǎn)足于現有融合基因篩查,對于整合項目有需求的患者檢測;
注:對于明確診斷患者還是建議選擇針對性強的融合基因篩查項目,對于兒童ALL患者,還是建議篩查陰性后加Ph樣ALL相關(guān)基因篩查。
四、采樣要求、收費標準及報告時(shí)間
項目代碼 |
項目名稱(chēng) |
檢測方法 |
標本類(lèi)型及注意事項 |
收費(元) |
報告周期 |
開(kāi)展時(shí)間 |
|
LIR |
新系統 |
||||||
GC161 |
81259 |
白血病中51融合基因篩查 |
熒光定量PCR法 |
1、 EDTA抗凝骨髓/1-3ml或EDTA抗凝外周血/3-5ml; 2、保存穩定性:室溫24小時(shí)、冷藏72小時(shí),禁止冷凍 |
2760 |
5-7天 |
2018年2月12日 |
感謝您給予的大力配合!
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廣州華銀醫學(xué)檢驗中心
二〇一八年五月三十一日