遺傳性耳聾基因檢測(100位點(diǎn))項目升級通知
2024-07-08 閱讀數:88
尊敬的客戶(hù):
首先感謝您一直以來(lái)對廣州華銀醫學(xué)檢驗中心的支持和信賴(lài)!
參考升級后的ACMG變異評級指南和更新后的耳聾相關(guān)研究文獻/數據庫,我中心于2024年7月15日起對“遺傳性耳聾基因檢測(100位點(diǎn))”項目進(jìn)行升級,詳情如下:
1. 檢測位點(diǎn)升級(刪除4個(gè)非致病性變異,新增4個(gè)致病性/用藥相關(guān)變異):
(1)隨著(zhù)變異評級規則的升級和文獻/數據庫的更新,刪除4個(gè)非致病性變異,其中1個(gè)位于MT-CO1 基因(m.7444G>A),2個(gè)位于SLC26A4 基因(IVS16-6G>A和IVS13+9C>G),1個(gè)位于GJB3 基因(c.421_423delATT),以減少臨床解讀的困擾;
(2)新增4個(gè)致病性/用藥相關(guān)變異(詳見(jiàn)表1);
(3)檢測基因數和位點(diǎn)數保持不變。
表1 新增變異信息
原耳聾100位點(diǎn)檢測項目-刪除位點(diǎn) |
升級后耳聾100位點(diǎn)檢測項目-新增位點(diǎn) |
|||||
位點(diǎn) |
ACMG評級 |
ACMG評級證據詳細描述 |
基因 |
位點(diǎn) |
ACMG評級 |
|
MT-CO1 |
m.7444G>A |
可能良性 |
BS1+BP2(FDA)。BS1:MITOMAP GenBank數據庫中的頻率為206/59389 (0.347%);gnomAD數據庫中頻率為302/56,419 (0.535%)。BP2:在患者中發(fā)現其它已知其他線(xiàn)粒體致病突變[m.3460G>A (PMID: 7901141); m.1555A>G (PMID: 16152638)] |
MT-RNR1 |
m.1095T>C |
用藥相關(guān) |
SLC26A4 |
IVS16-6G>A |
臨床意義未明 |
PM3+BS1。PM3:已在1名患者中觀(guān)察到該位點(diǎn)與其他致病位點(diǎn)組成復合雜合模式[PMID:30703224];BS1:在千人數據庫東亞人群頻率為0.03% |
GJB2 |
c.109G>A |
致病 |
SLC26A4 |
IVS13+9C>G |
臨床意義未明 |
PM2_Supporting。PM2_Supporting:人群數據庫中未收錄;BP2:隱性遺傳模式,存在另一個(gè)順式的致病變異(PMID:11502831) |
SLC26A4 |
c.916dupG |
致病 |
GJB3 |
c.421_423delATT |
暫未有合適證據,頻率處于PM2_Supporting與BS1_P之間,不適用。 |
MT-CO1 |
m.7443A>G |
臨床意義未明 |
2. 線(xiàn)粒體相關(guān)基因位點(diǎn)結果描述:
由原來(lái)的“野生型/異質(zhì)突變/均質(zhì)突變”改為“野生型/突變型(突變比例)”。本檢測報告中線(xiàn)粒體基因相關(guān)位點(diǎn)結果僅提示野生型和突變型,并根據該檢測方法提示突變比例, 但由于該檢測技術(shù)局限性或其他無(wú)法預知的原因,不能排除與其他方法學(xué)突變比例不一致的情況。
3. 報告模板更新:位點(diǎn)信息列表更新、線(xiàn)粒體檢測結果描述變更、參考文獻庫更新(部分位點(diǎn)更新至近三年的文獻)。
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廣州華銀醫學(xué)檢驗中心
二〇二四年七月八日