核心發(fā)明專(zhuān)利獲得授權！集團免疫組庫測序就是這么6
2019-04-15 閱讀數：8047
近日，廣州華銀健康科技有限公司下屬子公司廣州華銀醫學(xué)檢驗中心自主研發(fā)的《基于分子標記的免疫組庫生物信息分析方法》發(fā)明專(zhuān)利獲得授權。一直以來(lái)，廣州華銀健康科技有限公司高通量測序事業(yè)部都專(zhuān)注于免疫組庫測序技術(shù)難題的攻克，該專(zhuān)利技術(shù)獲得授權，標志著(zhù)廣州華銀健康科技有限公司在免疫組庫高通量測序產(chǎn)品研發(fā)上的重大突破，也標志著(zhù)廣州華銀健康科技有限公司自主創(chuàng )新水平再上新臺階。
人類(lèi)或哺乳動(dòng)物的適應性免疫系統擁有大量的T細胞受體(TCRs)和B細胞受體(BCRs)，其總和統稱(chēng)為免疫組庫。免疫組庫高通量測序技術(shù)允許對T或B細胞克隆進(jìn)行深入分析，可以有效評估TCR/BCR互補決定區域(CDR3)的多樣性，并評估克隆類(lèi)型的構成：包括特定克隆類(lèi)型的比例;克隆之間的相似程度;V(D)J的基因使用頻率;核苷酸插入與缺失;CDR3區域長(cháng)度分布等信息，為評估健康或疾病狀態(tài)下的機體適應性免疫系統提供了可能。
廣州華銀健康科技有限公司作為國內最早開(kāi)展免疫組庫項目研發(fā)的團隊之一，早于2016年便與南方醫科大學(xué)（前第一軍醫大學(xué)）的科研團隊深度合作，并成功發(fā)表學(xué)術(shù)論文(Chen, et al. OncoImmunology (2016))。
此次廣州華銀健康科技有限公司推出的全新免疫組庫測序產(chǎn)品，其基于 5'RACE 的原理，在原始模板擴增前引入UMI序列進(jìn)行文庫構建，并使用具有廣州華銀健康科技有限公司自主發(fā)明專(zhuān)利的UMI標記與校正算法(發(fā)明專(zhuān)利號：201810618023.7)，對PCR擴增與測序過(guò)程引入的錯誤與偏倚進(jìn)行有效糾正，極大提高分析結果的準確度。
專(zhuān)利看點(diǎn)一：UMI減少錯誤與偏移
廣州華銀健康科技有限公司使用具有自主發(fā)明專(zhuān)利的UMI標記與校正算法技術(shù)，達到了75%以上的校正比(表1)，有效減少了測序和PCR擴增實(shí)驗過(guò)程中所引入的錯誤和偏移。
圖1. UMI標記消除測序和PCR擴增的錯誤
本項目所用的UMI(Unique Molecular Indices，分子條形碼)為16nt的隨機堿基短序列，可以看作分子條形碼。將隨機UMI序列于逆轉錄階段引入模板，標記原始樣本中的每個(gè)分子，對同一來(lái)源的擴增產(chǎn)物進(jìn)行標記；通過(guò)UMI標記與校正算法，可以排除PCR擴增偏好性和建庫過(guò)程中造成的誤差，并獲取原始的轉錄本數量，達到絕對定量。
表1. 經(jīng)過(guò)UMI算法校正后的部分測試數據校正比例統計表
專(zhuān)利看點(diǎn)二：重復性好，穩定性高
廣州華銀健康科技有限公司使用具有自主發(fā)明專(zhuān)利的UMI標記與校正算法技術(shù)，發(fā)現在相同的RNA起始量下同一樣本其相關(guān)性高且重現性好(圖2)。
圖2. 同一樣本RNA起始量相同時(shí)樣本間的相關(guān)性圖
（起始RNA量：A1/A2/A3為1600ng; B1/B2/B3為400ng）
對于RNA起始量低或高的樣本，隨著(zhù)測序深度的增加，均能夠快速達到測序平臺期，即數據量能夠滿(mǎn)足后續分析需求(圖3)。
圖3. 同一樣本RNA起始量不同時(shí)到達測序飽和期數據統計曲線(xiàn)圖
廣州華銀健康科技有限公司免疫組庫項目分析流程能夠對測序數據進(jìn)行多維度深入挖掘(圖4)，給出最全面的數據分析報告，并可按照客戶(hù)的需求定制個(gè)性化分析服務(wù)。
圖4：數據分析條目概覽
廣州華銀健康科技有限公司免疫組庫項目部分分析結果展示
樣本的CDR3氨基酸長(cháng)度分布圖
VJ Combination統計圖
樣本間VDJ基因共線(xiàn)性
樣本Rank abundance分布曲線(xiàn)圖
樣本Diversity分布曲線(xiàn)圖
