例如，拉斯穆森腦炎（RE）是一種罕見(jiàn)的兒科癲癇疾病伴隨有半腦炎癥和進(jìn)行性神經(jīng)系統缺陷。為了闡明RE的免疫病理過(guò)程，德國明斯克大學(xué)神經(jīng)學(xué)研究所對RE患者的22例血樣，2例腦脊液，和5例腦組織切片樣本還有兒科樣本參照進(jìn)行T細胞受體（TCR）測序。發(fā)現RE病人樣本表現為外CD8+ T細胞的擴散并且其長(cháng)度與疾病的嚴重程度相關(guān)。同時(shí)提示在RE中，外周擴散的CD8+淋巴細胞的抗原特異性的侵害與中樞神經(jīng)系統（CNS）相互對抗，可通過(guò)限制其進(jìn)入CNS來(lái)被改善。

RE特異性克隆具有較短的CDR3區域和Vβ基因

文獻來(lái)源：

Schneider-Hohendorf T, Mohan H, Bien CG, et al. CD8(+) T-cell pathogenicity in Rasmussen encephalitis elucidated by large-scale T-cell receptor sequencing. Nat Commun. 2016;7:11153 ; PubMed Central PMCID: PMCPMC4822013.

檢測免疫系統的多樣性，Glanville等利用Capture-Recapture 方法估計了IGM的種類(lèi)高達3.5×10¹⁰種。

抗體庫中重鏈和輕鏈CDRs的多樣性估計

參考文獻：

Glanville J, Zhai W, Berka J, et al. Precise determination of the diversity of a combinatorial antibody library gives insight into the human immunoglobulin repertoire[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2009, 106(48): 20216-20221.

免疫組測序技術(shù)可以精確的描述免疫系統的特點(diǎn)和狀態(tài)，可以展示生物體注射疫苗后的免疫系統的變化。免疫組庫測序技術(shù)在疫苗研發(fā)、疫苗有效性測試、特定抗原的抗體發(fā)掘、疫苗免疫性濁量等方面有廣泛的應用價(jià)值。

參考文獻：

Galson J D, Pollard A J, Truck J, et al. Studying the antibody repertoire after vaccination: practical applications[J]. Trends Immunol, 2014, 35(7): 319-331.

微小殘留?。╩inimal residual disease，MRD）監控：白血病人經(jīng)過(guò)治療以后，體內白血病細胞數量通常會(huì )下降至正常水平。白血病誘導化療完全緩解后（或骨髓移植治療后），在體內殘留少量白血病細胞的狀態(tài)，通常稱(chēng)有白血病細胞微小殘留（MRD）。由MRD引起白血病的復發(fā)經(jīng)常會(huì )使得病人及醫生措手不及，因此對微小殘留靈敏的檢測和監控十分重要。

通過(guò)高通量測序分析免疫組庫，對比正常人群的免疫組庫和白血病人的免疫組序列，找出相關(guān)致病克隆。通常，一個(gè)致病克隆對應一個(gè)白血病細胞，通過(guò)摻入一定量的已知拷貝數的分子標記，就可以相對精確地判斷出病人體內白血病細胞的數量，從而及時(shí)指導白血病的臨床治療及用藥。

高通量測序與多參數流式細胞術(shù)治療前和治療后第29天B淋巴母細胞頻率比較，通過(guò)高通量測序（紅色）或多參數流式細胞術(shù)（藍色；N=91）鑒定出克隆B淋巴細胞

參考文獻：

Wu D1, Emerson RO2, Sherwood A2, et al. Detection of minimal residual disease in B lymphoblastic leukemia by high-throughput sequencing of IGH.Clin Cancer Res. 2014 ,20(17):4540-4548.

腫瘤的異質(zhì)性一直是困擾人們研究的一個(gè)方面，腫瘤浸潤淋巴細胞是否是異質(zhì)性的？Emerson等通過(guò)對卵巢癌浸潤T細胞的高通量測序研究發(fā)現浸潤T細胞在腫瘤不同空間位置上是相似的。使用單個(gè)組織樣本定量評估腫瘤浸潤淋巴細胞的能力對于評估TCR測序作為實(shí)體瘤中潛在的預后和預測生物標志物至關(guān)重要。

患者TCRB庫重疊的聚類(lèi)分析

參考文獻：

Emerson R O, Sherwood A M, Rieder M J, et al. High-throughput sequencing of T-cell receptors reveals a homogeneous repertoire of tumour-infiltrating lymphocytes in ovarian cancer[J]. J Pathol, 2013, 231(4): 433-440

另外，有多篇臨床研究立足于COVID-19的免疫學(xué)研究，力求通過(guò)免疫狀態(tài)監控評估，找到與COVID-19感染進(jìn)程相關(guān)的標志物或預后評估的線(xiàn)索。鐘南山院士團隊在臨床上的研究指出，淋巴細胞減少可見(jiàn)于83.2%的新冠肺炎感染患者中，尋找病毒破壞淋巴細胞的關(guān)鍵機制，將幫助臨床醫生通過(guò)調節患者的免疫功能而提高救治成功率，強調了新冠病毒宿主免疫研究的重要性。免疫組庫還可用來(lái)研究外周血中免疫抗體、免疫分子和免疫細胞，觀(guān)察病程當時(shí)的免疫狀態(tài)；研究淋巴結/胸腺的生發(fā)中心，觀(guān)察中長(cháng)期免疫應答；更可以研究骨髓中長(cháng)壽漿細胞，觀(guān)察長(cháng)期免疫應答。

總之，免疫組庫的研究范圍是非常的廣泛，免疫治療更是成為自身免疫性疾病、癌癥、感染性疾病等發(fā)展最快速的領(lǐng)域。在“大數據時(shí)代”的今天，通過(guò)高通量測序技術(shù)去解碼我們自身免疫系統中的大數據，這為人類(lèi)免疫系統的研究開(kāi)辟了新的技術(shù)與思路，推動(dòng)免疫學(xué)進(jìn)一步的探索與發(fā)展。